Мокроту собирают утром натощак. Перед отбором необходимо почистить зубы и прополоскать рот и горло теплой кипяченой водой, сделать несколько глубоких вдохов. Собирается свободно отделяемая (отхаркиваемая) мокрота (для лучшего отхождения мокроты накануне можно использовать ингаляции с физраствором или принять отхаркивающие средства). Для отбора используются стерильные одноразовые контейнеры с завинчивающимися крышками или стерильные стеклянные банки (выдаются в лаборатории или приобретаются в аптечной сети). Контейнер должен быть подписан.