В клинико-диагностической лаборатории проводятся в рутинной практике исследования глубже, чем того требуют стандарты. Это возможность реализована благодаря союзу практической лаборатории и научных отделов Центра. Так, например, комплексная стратегия, направленная на ускоренную детекцию и типирование возбудителей нейроинфекций: менингококков и пневмококков, а также определение механизмов резистентности к антибактериальным препаратам с помощью молекулярно-генетических методов реализована благодаря тесному сотрудничеству с НИО медицинской микробиологии и молекулярной эпидемиологии. Результаты имеют важное значение также в эпидемиологическом мониторинге как на территории РФ, так и на глобальном международном уровне.