Наука
Основные задачи отдела
- Проведение научно-исследовательской работы в области изучения, диагностики и эпидемиологического мониторинга возбудителей инфекций, соответствующих профилю отдела.
- Проведение научно-исследовательской и организационно-методической работы по разработке новых систем комплексной диагностики инфекций, соответствующих профилю отдела.
- Изучение этиологии вирусных инфекций у детей, а также вирусологических основ патогенеза наиболее актуальных нозологических форм
- Организация работы по внедрению научных достижений отдела в практическое здравоохранение.
- Проведение образовательной деятельности по совершенствованию вирусологических и молекулярно-биологических методов диагностики инфекционных заболеваний.
Основные направления научной деятельности отдела
Основные исследовательские направления:
- Разработка и апробация инновационных диагностических методик с созданием алгоритмов для верификации и прогноза течения инфекционных заболеваний;
- Идентификация вирусов с определением их генетической принадлежности и штаммовой изменчивости, а также мониторинг эпидемических свойств;
- Исследование влияния штаммов вирусов и генома пациентов на возникновение инфекционных заболеваний с выявлением рисков развития тяжелых патологий;
- Определение клеточного и гуморального иммунитета к актуальным и вновь выявляемым вирусным инфекциям;
- Создание коллекций биологических образцов пациентов с различными инфекционными заболеваниями.
Приоритетные области:
- Определение влияния молекулярно-генетических маркеров на риск возникновения, характер и прогноз течения инфекционного заболевания для выбора эффективной терапии и разработки индивидуальных программ реабилитации;
- Исследование популяционных особенностей носительства основных штаммов вирусов и генома пациентов на устойчивость к инфекционным заболеваниям, а также риск развития редких заболеваний, в первую очередь связанных с первичными иммунодефицитами, в том числе с развитием тяжелых патологических состояний с повреждением органов и тканей;
- Разработка эффективных подходов к этиологической диагностике вирусных инфекций с возможностью определения формы инфекционного процесса (носительство; инаппарантная, субклиническая, манифестная, латентная формы; медленная инфекция);
- Мониторинг вновь появляющихся вирусов, идентификация, проведение исследований генетической принадлежности и штаммовой изменчивости вирусов, эпидемических характеристик;
- Разработка, апробация и внедрение качественно-новых диагностических методик для использования в научных исследованиях и практической медицине;
- Биобанкинг (создание коллекций биообразцов пациентов).
Ключевые проекты:
- В рамках выполнения Государственного НИО экспериментальной медицинской вирусологии и молекулярной генетики осуществлена разработка алгоритма диагностики вирусов герпеса при сочетанном инфицировании, предложена эффективная тактика комплексной вирусологической диагностики инфекции, ассоциированной с бетагерпесвирусом человека 6 типа А/В, у детей.
- Предложен способ прогноза манифестных форм врожденной цитомегаловирусной инфекции в антенатальный период, поддержанный грантом Комитета по науке и высшей школе Санкт – Петербурга.
- Выполняются диссертационные исследования на тему генетического разнообразия цитомегаловируса и разработки лабораторных подходов диагностики клинически значимых генотипов; генотипических особенностей вируса Varicella zoster и их связи с развитием патологического процесса; генетического разнообразия вируса эпидемического паротита и разработки ПЦР-метода для определения этиологии заболевания, в том числе при нежелательных проявлениях после проведения вакцинации.
- Проводится ряд исследований по выявлению роли функционально-значимого полиморфизма генов в развитии синдрома некомпактного миокарда и применению NGS-технологий для исследования генетических факторов риска инфекционных и неинфекционных заболеваний человека.
Оборудование и технологии
Используемое оборудование:
Система для автоматического выделения и очистки нуклеиновых кислот из биологического материала Auto-Pure 96, Allsheng (Китай); ДНК-амплификаторы с функцией real-time ПЦР: CFX96 Touch, Bio-Rad (США), DTprime ДНК-Технология (Россия), Gene Explorer Hangzhou Bioer Technology Co., LTD (Китай) и др. Система QX100 Droplet Digital PCR System для цифровой капельной ПЦР, Bio-Rad (США). Секвенаторы LOCUS Seqtor 1616 (Китай), ABI 3730 DNA Analyzer, Applied Biosystems (США); Illumina MiSeq, Illumina, Inc. (США), GridION Oxford Nanopore Technologies (Великобритания).
Вспомогательное оборудование:
системы капиллярного электрофореза, флуориметры, спектрофотометры, термостаты, центрифуги (включая низкоскоростные и вортексы), вакуумные насосы, концентраторы, дозаторы, ПЦР-боксы, системы гель-документации и т.д.
Методологии:
серологические методы (иммуно-ферментный анализ, иммуноблот), SPOT, молекулярно-биологические методы (real-time ПЦР, секвенирование геномов, включая NGS).
Контакты:
197022, Санкт-Петербург, ул. Профессора Попова, д.9